Bitkisel ekstraktlar genellikle birden fazla aktif bileşik içerir ve bu bileşikler arasında enzimler de olabilir. Bitkisel ekstraktlar içindeki enzimlerin türü ve aktivitesi, bitkinin türüne, ekstraksiyon yöntemine ve kullanılan çözücüye bağlıdır.
Bazı bitkilerin ekstraktları, proteolitik enzimler (proteinleri sindiren enzimler) içerebilir. Örneğin, ananas ekstresi bromelain adlı bir proteolitik enzim içerir. Papaya ekstresi de papain adı verilen bir proteolitik enzim içerir. Bu enzimler, sindirim sistemi sorunları, inflamasyon ve diğer sağlık sorunlarının tedavisinde kullanılır.
Bazı bitkisel ekstraktlar, selüloz gibi polisakkaritleri sindiren enzimler içerebilir. Bu enzimler, selülozun sindirimine yardımcı olabilir ve sindirim sistemi sorunlarının tedavisinde kullanılabilir.
Bitkisel ekstraktlarda bulunan enzimlerin diğer bir örneği, antioksidan aktivitesi olan enzimlerdir. Örneğin, çay ekstresi kateşinler içerir ve bu bileşikler antioksidan aktiviteye sahip olan bir enzim olan süperoksit dismutazı (SOD) etkinleştirir.
Ancak, bitkisel ekstraktlarda bulunan enzimlerin aktivitesi, ekstraksiyon yöntemine ve işleme sürecine bağlı olarak değişebilir. Bu nedenle, bitkisel ekstraktlarındaki enzim etkinliğinin belirlenmesi için titiz birçok araştırma gereklidir.